-
CPB沉淀法純化放射性標(biāo)記的寡核苷酸實驗
發(fā)布時間: 2021-12-20 點擊次數(shù): 953次材料與儀器
十六烷基溴化吡啶 EDTA-Tris EDTA-Tris-DNA 溶液 乙醇-乙酸鈉溶液 乙醇 乙酸鈉 TE(pH7.6) 或適當(dāng)?shù)念A(yù)雜交液 核酸和寡核苷酸 純化的原料
干冰 乙醇浴步驟
材料
溶液和緩沖液
稀釋貯存液至適當(dāng)濃度。
十六烷基溴化吡啶(CPB)1%,m/V)
將 1 gCPBW(sigma 公司)溶于 100 ml 水中,加熱并用磁力攪拌器攪拌溶液可加速溶解。待去污劑全部溶解后,將溶液冷卻至室溫,用硝酸纖維素濾膜過濾(0.45um 孔徑)
EDTA-Tris(0.5mol/L,pH6.0)
用 60 ml 水溶解 0.1mol EDTA, 在攪拌溶液的同時, 加入 Tris 堿(粉末),直到溶液 pH 值達(dá)到 6.0, 此時 Tris 的濃度為約 1.2mol/L。加水使溶液的體積為 200 mL。這不同于常規(guī)配制方法,但對于陽離子去污劑有效地沉淀核酸是非常必要的(Sibatani1970)。
EDTA-Tris-DNA 溶液
用 50 mmol/LEDTA-Tris(pH6.0)(1:10 稀釋 0.5mol/LEDTA-Tris 溶液)溶解載體 DNA(鮭精DNA), 使其濃度為 50ug/ml 載體 DNA 應(yīng)大小均一、不干擾放射性標(biāo)記核酸與靶 DNA 的雜交。用超聲處理或鮭精 DNA 片段可滿足多數(shù)實驗的要求(超聲處理鮭精 DNA 的長度在 600~5000bp,可以從 Pharmacia 公司購得或按第 6 章的方案 10 制備)。
乙醇-乙酸鈉溶液
80%(V/V) 乙醇
20%(V/V) 乙酸鈉(0.1mol/L,pH5.2)
TE(pH7.6) 或適當(dāng)?shù)念A(yù)雜交液
見步驟 8。
核酸和寡核苷酸
放射性標(biāo)記的寡核苷酸
純化的原料是方案 2(步驟 3 或步驟 5) 的反應(yīng)混合液,T4 噬菌體多核苷酸激酶已在 68°C 滅活。
專用設(shè)備
干冰/乙醇浴
方法
1. 含有放射性標(biāo)記的寡核苷酸的微量離心管中加入 5~10 倍體積的 EDTA-Tris-DNA 溶液,充分混合。
為進(jìn)行有效的沉淀,務(wù)必使終末反應(yīng)混合液中 EDTA-Tris-DNA 溶液的離子成分占優(yōu)勢,混合液的終體積與放射性標(biāo)記寡核苷酸的濃度對本方法的效率不產(chǎn)生影響。
2. 加入足量的 1%CPB, 使離心管中混合液的去污劑濃度達(dá)到 0.1%, 充分混勻。
3. 將離心管置于干冰/乙醇浴中至混合液凍結(jié)。從冰浴中取出離心管,室溫下使混合液融化。
4.4°C 下以最大轉(zhuǎn)速離心 5 min, 用巴斯德吸管或裝有一次性藍(lán)吸頭的微量移液器小心吸去管中的上清。
警惕:上淸中含大部分未摻入的 [γ-32P]ATP。磷酸化反應(yīng)常使用大于100uCi 的放射性標(biāo)記 ATP,因此上清中放射性劑量相當(dāng)可觀,應(yīng)小心謹(jǐn)慎處理未摻入的放射性物質(zhì)、移液器吸頭及離心管。
5. 在管中加入 500ul 蒸餾水,振蕩 20s, 再次按步驟 4 離心。
6. 吸去管中上清,加入 500ul 乙醇-乙酸鈉溶液,振蕩 15s,隨后在室溫下以最大轉(zhuǎn)速離心 2 min。
7. 重復(fù)步驟 6。
8. 小心吸去上清。打開離心管蓋,放置在試驗臺聚異丁烯酸樹脂有機(jī)玻璃防護(hù)屏后,直到剩余可見的乙醇揮發(fā)干凈。用 20~50ulTE(pH7.6) 溶解沉淀的寡核苷酸。如放射性標(biāo)記的寡核苷酸用作探針,則用小體積預(yù)雜交液溶解。以上就是本期的內(nèi)容,更多資訊,歡迎關(guān)注安培生物科技有限公司了解更多技術(shù)與產(chǎn)品資訊。
安培生物科技有限公司介紹:
安培生物堅持為生命科學(xué)研究、活體動物轉(zhuǎn)染、大規(guī)模生物生產(chǎn)、基因和細(xì)胞治療領(lǐng)域客戶,提供*細(xì)胞體內(nèi)可代謝的核酸轉(zhuǎn)染試劑;inviCELL™Platelet lysate無動物血清產(chǎn)品旨在支持廣泛的細(xì)胞擴(kuò)增和生產(chǎn),包括培養(yǎng)間充質(zhì)干細(xì)胞和多種免疫細(xì)胞系等,為制藥公司或者生物技術(shù)公司提供無血清細(xì)胞培養(yǎng)規(guī)模生產(chǎn)服務(wù);提供以植物生物為平臺基因序列全人源化、*的細(xì)胞培養(yǎng)可分解3D基質(zhì)膠產(chǎn)品;提供內(nèi)毒素≦ 1.0 EU/mL、對細(xì)胞無毒性影響、高純度的一型膠原蛋白產(chǎn)品。安培生物專注為生物醫(yī)藥領(lǐng)域提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品和技術(shù)服務(wù),努力發(fā)展為基因治療、細(xì)胞治療的生物科技企業(yè)。
-
血清系列
-
細(xì)胞轉(zhuǎn)染
-
支原體清除
-
細(xì)胞凍存
-
實驗耗材
-
分子試劑
-
細(xì)胞增殖與凋亡
-
Biozellen系列
-
培養(yǎng)基
-
ELISA試劑盒
-
TOYOBO(東洋紡)
-
ZYMO RESEARCH
-
Greiner(格瑞納)
-
IKA(艾卡)
-
化學(xué)發(fā)光底物(ECL)
-
PROSPEC系列
-
Epigentek系列
-
微生物檢測
-
細(xì)胞生物學(xué)
-
Corning康寧
-
解離試劑
-
細(xì)胞類-實驗耗材
-
原代細(xì)胞
-
植物檢測系列試劑盒
-
SERANA
-
細(xì)胞系
-
生化試劑盒
-
環(huán)境檢測系列試劑盒(AKEN)
-
類器官培養(yǎng)
-
緩沖器和解決方案
-
生物三凝膠基質(zhì)
-
細(xì)胞因子分子
-
生物樣本庫